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此时日本忍者的地位已经不同于以前，很多以世代传家的忍者为了生计都开始了转行，如果不是此前日本多次从军队中派遣身手和枪法都比较厉害的士兵刺杀徐卫都没有成功，也想不到这些只会使用冷兵器的忍者。
日本这次派遣的三个忍者都是在忍者行业精英中的精英，其中领头的那位出身于历代侍奉皇室的忍者家族，对日本皇室有着绝对的忠诚，而另外两名则是从古老的忍者世家选取的，受现代化思想的冲击已经没有了誓死效忠雇主的职业操守。
那两名已经招供的忍者自然明白自己已经回不了头了，故而对于徐卫提出让他们向警卫连士兵传授忍术并没有太大的排斥，至于那位宁死不屈的忍者，徐卫则成全了他的忠心，让他成为了烈士，而执行刑罚的则是他之前的两个同伴。
根据那两名日本忍者的交代，第二师的军队在釜山港警察的协助下很快就控制了接待他们的杂货铺，捉住了因为全城戒严还没能够逃走的一家三口，然后进行突击审讯。
提供接待工作的杂货铺一家三口并不是日本政府专业的间谍，从身份上顶多算是朝鲜籍日本人，经过一番审讯很快就获得了为他们下达命令的日本专业间谍的身份信息，不过可惜的是在军队和警察到达那名间谍藏身之地的时候那名间谍已经烧毁了所有的文件，然后饮弹自尽了。
这次的刺杀工作只能算是日本政府所有应对措施中的一种，其实包括下达命令的日本明治天皇和首相西园寺公望也没有对它抱有多大的希望。
自日本政府收到由朝鲜驻日公使正式提交的宣战书后便开始了战争的准备，首先他们要做的就是将遍布在国内各个地方的常备军补充完整，然后再将预备役武装起来，这个过程至少需要一个月的时间。
日本政府自1871年在国内实行征兵制。先后设立了兵部省和早期的东京、大阪、镇西、东北四个镇台，1874年在四镇台的基础上改编为六镇台，1888年日本陆军将国内原有的六个按地域划分的镇台改称师团，序号从第一至第六师团，1891年为警卫皇宫又成立了近卫师团。
日本的师团编制采取两旅团、四步兵联队，再加炮兵、辎重和骑兵联队。平时兵额超过两万人，战时足额则超过两万七千人，其中甲午战争前成立的七个老牌师团后来一直被日本陆军视为第一等部队，装备优先保障。
甲午战争结束后，日本在财政方面有了很大的提升，于是便成立了第七师团到第十二师团六个师团，随后在日俄战争时期又成立了第十三师团至第十六师团四个师团，日俄战争结束后成立了第十七师团和第十八师团。
通过日俄战争的胜利，日本成功的将俄国的势力驱逐出北朝鲜。占领朝鲜全境，随后朝向境内爆发了遍及全国的义兵运动，于是为了弹压地方日本政府又建立了第十九师团和第二十师团，而序号从七至二十的师团则被日军视为二等师团。