昏暗的天空，漫漫的长夜中，最容易令人忘记时间，转眼间百年已逝。
100年过去了。当年亚当发明的后文明核能修炼法也发展的极好，糅合上个时代的基因法，通过可控的基因变异强化自身。
在无数次的失败，研究下，人们发现了一系列良性变异，而这就是如今时代的修炼道路。
任何事情都有双面性，核能可为毁天灭地的能量，也可促进基因变异进化。
在修炼法确定好后，所有人心中的永恒领袖先知消失了，从最初的骚动，到之后在亚当的指挥下方舟继续航行，人类仍在竭力生存。出生在这个时代的人，内心最是坚韧，如同钢铁一般，百折不挠。
如今方舟已经分裂出了数个人类避难所，毕竟鸡蛋不能放在一个篮子上，如锡安、玉京，他们隐藏在盖亚不同角落，或是如母体方舟一般，每时每刻都在运动航行着，或是隐藏在生物绝迹的禁地，亦或唯一还保留上纪元生态圈的深海海沟。
人类聚集地之名大多以当年人类文明巅峰时期的名城而命名，如今新人类只能在历史书上追溯那遥远不可追寻的文明荣光。
这是一个废土时代，除了聚集地过滤有毒物质，人类能自由活动，外界至今还是一片焦土与灰雪，虽有点滴杂草，但不适合人类居住。
当年先知说的没错，如今时代属于变异兽的，尘埃掩盖文明光辉，一座座断壁残垣宣告着往日辉煌，时不时有一两只造型怪异的变异兽从角落中钻出，小心的奔走。
而有时候又有全副武装的探索小队手持机枪大炮来探索，他们感慨第五纪的辉煌，又疑惑究竟是谁造成了这一切。
在人类慢慢壮大之时，全球出现不同变异兽，内核之中也升起了诡异变化，分裂出无数意识的黑暗盖亚的周围世界泡影的世界越来越真实......
“嗨，克罗教授，你是要去丹西联邦的布雷拉城参加关于光学话题的研究会吗？”
繁华的未来都市中，正有不断行走的行人、机器人，其中一位教授向穿着西服的同僚打招呼，对面的克罗教授点了点头，二人畅谈起来。
周围的盛世繁华之景与600年前毁灭的第五纪一模一样，而在这座都市中生活的一位位人没有想到他们的记忆永远停留在了死去的那一刹那间。
这些全都是惨死在灭世浩劫下的人类残识，或是被盖亚吞噬仍在顽强抵抗的最深执念，以及被盖亚活擒的机械人意识。
微尘之土，众聚成星。即使是再微弱的意识不断凝聚，最终也会成为干扰盖亚的一股不可忽视力量。
“呵呵。”
瞧见自己编织的世界中，一位位人类在其中欢乐生活，不断攻克科研难关，为未来而奋斗，黑暗盖亚似乎觉得很有趣，不自觉的笑了起来。